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原子力顯微鏡是新興顯微鏡，仍然有一些帶改進(jìn)，但它是目前正在應(yīng)用于深?yuàn)W的學(xué)科，在電子，化學(xué)和生物等領(lǐng)域的廣泛的研究
原子力顯微鏡，掃描電子顯微鏡（SEM）的優(yōu)勢(shì)。之一，原子力顯微鏡可以在周?chē)目諝饣蛞后w環(huán)境功能，不像電子顯微鏡需要在真空中進(jìn)行，所有探頭。鑒于此，研究人員已經(jīng)開(kāi)始檢測(cè)原子力顯微鏡的適用性研究在納米尺度的生物體（例如，掃描和研究生物大分子,倒置生物顯微鏡，如DNA等等）。
一方面，原子力顯微鏡可以繪制三維圖像;
但是SEM只可以提供一個(gè)二維圖像或投影樣品。
另一方面，一個(gè)原子力顯微鏡的主要缺點(diǎn)是它可以掃描的區(qū)域，它可以產(chǎn)生的圖像分辨率。可以掃描電子顯微鏡以毫米為單位計(jì)量的面積;
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